中文Güney Afrika'nın Yeni Coronavirus Varyant Suşu 501Y-V2
18 Aralık 2020'de Güney Afrika, yeni koronavirüsün 501Y-V2 mutantını tespit etti.Şimdi Güney Afrikalı mutant 20'den fazla ülkeye yayıldı.Deneyler, Yeni Corona virüsü Mutantlarının, aşı kaynaklı plazma nötralize edici antikorların nötralize etme yeteneğini azaltabilen K417N/T, E484K ve N501Y mutasyonlarının diğer Yeni Coronavirüs varyantlarını taşıyabileceğini göstermiştir.Bununla birlikte, referans genom Wuh01 (dizi numarası MN908947) ile karşılaştırıldığında, Güney Afrika mutant genom dizisinin 501Y.V2'si 23 nükleotid varyantına sahiptir.Britanya mutantı B.1.1.7 alt tipi ile aynı N501Y mutasyonuna sahiptir, ancak yine de, virüsün enfekte etme yeteneği üzerinde potansiyel olarak önemli etkileri olan S proteininin iki kilit bölgesinde E484K ve K417N mutasyonları içerir.
Yeni Coronavirüs, Genom mutasyonlarının daha sık görüldüğü Tek sarmallı bir RNA Virüsüdür.Tek hedef tespiti, düşük viral yüke ve mutasyona uğramış virüs suşlarına sahip örneklerin kolayca kaçırılmasına neden olabilir.Hedef tespitinde tek pozitifte yeniden inceleme oranı %10'u aşabilir, bu da iş yükünü artırabilir ve teşhis süresini uzatabilir.Çoklu hedef tespiti ve her bir hedefin sonuçlarının karşılıklı olarak doğrulanması, tespit oranını artırabilir ve erken teşhisi kolaylaştırabilir.
Şekil 1. Yeni Coronavirüs enfeksiyon mekanizmasının şematik diyagramı
İngiltere'nin Yeni Coronavirüs Mutantı B.1.1.7
26 Aralık 2020'de B.1.1.7 Suşunun ilk bilimsel makalesi çevrimiçi olarak yayınlandı.Londra İngiltere Üniversitesi Hijyen Enstitüsü ve Tropikal Hastalıklar, B.1.1.7 Suşunun diğer suşlardan daha fazla yayılma kabiliyetine sahip olduğunu doğruladı, bu oran %56'dan fazlaydı (%95 CI %50-74).Bu yeni mutant suşun daha belirgin iletim gücü olduğundan, COVID-19'u kontrol etmek daha zor hale geldi.Ertesi gün, Birleşik Krallık'taki Birmingham Üniversitesi, MedRxiv hakkında bir makale yükledi.Çalışma, B.1.1.7 mutant suşu (S-gen düşüşü) ile enfekte olmuş hastalarda ORF1ab ve N virüsü gen kopyalarının sayısının önemli ölçüde arttığını bulmuştur;bu fenomen popülasyonda izlendi.Bu makale, İngiltere'deki mutant B.1.1.7 ile enfekte olmuş hastaların önemli ölçüde daha yüksek viral yüke sahip olduğuna ve dolayısıyla bu mutantın daha patojenik olabileceğine işaret etmektedir.
Şekil 2. İngiltere'nin koronavirüs mutant suşu B.1.1.7'de bulunan genom mutasyon dizisi
Şekil 3. N501Y mutasyonu hem İngiltere'de hem de Güney Afrika'da meydana geldiVaryantlar
Yeni Koronavirüs Varyantlarının Tespit Kiti
Chuangkun Biotech Inc., B.1.1.7 ve 501Y-V2 yeni koronavirüs varyantları için başarılı bir tespit kiti geliştirdi.
Bu ürünün avantajları: B.1.1.7 mutant suşu ve 501Y.V2 Güney Afrika mutant suşunun ana mutasyon bölgelerini kapsayan yüksek hassasiyet ， 4 hedefin eşzamanlı tespiti.Bu kit, N501Y, HV69-70del, E484K mutasyon bölgelerini ve yeni koronavirüs S genini aynı anda tespit edebilir;Hızlı test: Numune alımından sonuca kadar sadece 1 saat 30 dakika sürer.
Şekil 4. COVID-19 İngiltere Varyant Amplifikasyon Eğrisinin Tespiti
Şekil 5. COVID-19 Güney Afrika Varyant Amplifikasyon Eğrisinin Tespiti
Şekil 6. Wild-type New koronavirüs amplifikasyon eğrisi
Bu mutasyonların pandemi COVID-19'un yeni uzun vadeli etkilerini nasıl biriktirdiği açık değildir.Ancak bu bize bu mutasyonların aşılamanın getirdiği doğal bağışıklığın ve bağışıklığın etkinliğini etkileyebileceğini hatırlatıyor.Ayrıca bize yeni koronavirüsü uzun süre sürekli olarak izlememiz ve yeni koronavirüsün evrimi ile başa çıkmak için COVID-19 aşısını güncellememiz gerektiğini hatırlatıyor.
Gönderim zamanı: Mart-12-2021